¹Институт биохимии и физиологии микроорганизмов им. Г.К. Скрябина РАН – обособленное подразделение ФИЦ Пущинский научный центр биологических исследований РАН, Пущино, Россия
²Университет ИТМО, Санкт-Петербург, Россия

Аннотация. В статье рассматривается распространение генов hlyII и hlyIIR, кодирующих гемолизин II и его транскрипционный регулятор, среди геномов Bacillus cereus sensu lato. Наряду с полноразмерным токсином описано наличие укороченных форм HlyII. Биоинформатический анализ 4962 геномов показал, что 1408 генома содержат оба гена hlyII и hlyIIR, 584 генома — hlyIIR и укороченные формы hlyII, а 2699 геномов (54.4 %) не содержат ни одного из этих генов. В 84 % геномов B. anthracis (419 из 496) выявлен полноразмерный ген hlyIIR, тогда как ген hlyII содержит мутацию, нарушающую рамку считывания, которая восстанавливается в 3’-области гена. Таким образом, эти штаммы способны синтезировать укороченные с N-конца варианты белка HlyII. Среди геномов Bacillus cereus sensu lato не выявлено случаев наличия гена hlyII (полноразмерного или укороченного) при отсутствии гена hlyIIR. Анализ выравненных участков оператора, узнаваемых регулятором HlyIIR, выявил их зеркальную симметрию и полную комплементарность внутри этой последовательности. Наиболее вариабельна центральная часть последовательности (нуклеотиды 21–25), где может быть нарушен принцип палиндромности. Наиболее консервативна последовательность TTTAAA, повторяющаяся в операторе четыре раза. Анализ участков ДНК, расположенных перед геном hlyII выявил консервативные и вариабельные регионы, критические для ДНК-белкового взаимодействия и потенциально участвующие в регуляции гена hlyII.

Ключевые слова: Bacillus cereus, факторы патогенности, гемолизин II, регуляция транскрипции, оператор, ДНК–белковое узнавание, HlyIIR, Fur, ResDE