Русская версия English version   
Том 20   Выпуск 2   Год 2025
Метод оценки выполнимости второго правила Чаргаффа. Тестирование правила на бактериальных хромосомах

Панюков В.В.

Институт математических проблем биологии РАН – филиал Института прикладной математики им. М.В. Келдыша Российской академии наук, Пущино, Россия
 
Аннотация. В 1979 году Чаргафф опубликовал математическую формулировку своего второго правила, которое заключается в том, что в каждой из комплементарных цепей двух цепочечной ДНК наблюдается равенство количества аденина количеству тимина и равенство количества гуанина  количеству цитозина. Это правило, к настоящему времени, проверено  на многочисленных группах последовательностей относящихся к различным организмам и, при небольшом количестве исключений, подтверждено в большинстве случаев, но заключения о выполнимости правила носят скорее качественный чем численный характер. Насколько нам известно,  масштабных тестирований правила на бактериальных геномах не проводилось. В предлагаемой работе правило тестируется на 38830 бактериальных невырожденных последовательностях извлечённых из рипозитария NCBI GenBank 2023. Мы осуществляем более полный, чем это принято в литературе, статистический, анализ выполнимости правила в бактериальных геномах. Предложен новый подход к оценке справедливости правила. 
 

Ключевые слова: второе правило Чаргаффа, геномы бактерий, неравенство Высочанского – Петунина 

Содержание Оригинальная статья
Панюков В.В. Метод оценки выполнимости второго правила Чаргаффа. Тестирование правила на бактериальных хромосомах. Математическая биология и биоинформатика. 2025;20(2):494-508. doi: 10.17537/2025.20.494
(опубликована на рус. яз.)

Аннотация (рус.)
Аннотация (англ.)
Полный текст (рус., pdf)
Список литературы Перевод на англ. яз.

Panyukov V.V. A Method for Evaluating the Feasibility of Chargaff's Second Rule. Testing the Rule on Bacterial Chromosomes. Маthematical biology and bioinformatics. 2025, 20(Suppl.):t63-t77. doi: 10.17537/2025.20.t63

Полный текст (англ., pdf)

 

  Copyright ИМПБ РАН © 2005-2026