 |
|
 |
 |
 |
|
 |
|
 |
|
 |
|
 |
|
 |
|
 |
|
|
|
| Том 20 Выпуск 2 Год 2025 | ||
Оценка локальной неоднородности крио-ЭМ карт в прямом пространстве для пилей типа I из E. coli
Лунин В.Ю., Лунина Н.Л., Петрова Т.Е. Институт математических проблем биологии РАН – филиал Института прикладной математики им. М.В. Келдыша Российской академии наук, Пущино, Россия
Аннотация. Точность оценки разрешения экспериментальной крио-ЭМ карты рассеивающей плотности имеет решающее влияние на точность определения параметров неопределенности положений атомов (ADP параметров) при уточнении в прямом пространстве. Разработанная ранее методика оценки локального разрешения крио-ЭМ карт распределения методами прямого пространства была применена к исследованию карт для пилей типа I из E. coli. Исследование 4 карт, полученных тремя группами исследователей, показало, что для каждой из трех стандартных карт разрешение может считаться постоянным и составляет порядка 2.6–2.7 Å. В то же время, для обостренной карты разрешение выше и составляет 2.3 Å.
Ключевые слова: структурная биология, крио-ЭМ карты, уточнение в прямом пространстве, локальное разрешение, оболочечные функции
|
Содержание
Оригинальная статья
Лунин В.Ю., Лунина Н.Л., Петрова Т.Е. Оценка локальной неоднородности крио-ЭМ карт в прямом пространстве для пилей типа I из E. coli. Математическая биология и биоинформатика. 2025;20(2):509-519. doi: 10.17537/2025.20.509 (опубликована на рус. яз.) Аннотация (рус.) Аннотация (англ.) Полный текст (рус., pdf) Список литературы Перевод на англ. яз. Lunin V.Y., Lunina N.L., Petrova T.E. Estimation of Local Heterogeneity of Cryo-EM Maps in Direct Space for Type I Pilus from E. coli . Маthematical biology and bioinformatics. 2026, 21(Suppl.):t1-t10. doi: 10.17537/2026.21.t1 Полный текст (англ., pdf)
|
|