Русская версия English version   
Том 20   Выпуск 2   Год 2025
Нанопоровое секвенирование в геномике, метагеномике и эпигеномике: инструменты и алгоритмы анализа

Ерёмин А.А., Сергеев А.В., Зверева М.Э., Хренова М.Г.

Московский государственный университет имени М.В.Ломоносова,  Москва, Россия

 
Аннотация. Нанопоровое секвенирование представляет собой перспективную технологию определения последовательности фрагментов ДНК и РНК. В данной работе рассматриваются современные алгоритмы и программные инструменты, применяемые для анализа данных нанопорового секвенирования в геномике, метагеномике и эпигеномике. В статье описаны алгоритмы наиболее распространенных программных инструментов, включая их преимущества и ограничения. Представленный обзор  полезен для исследователей, занимающихся анализом данных нанопорового секвенирования, а также для разработчиков новых методов обработки биоинформатических данных.
 
Ключевые слова: нанопоровое секвенирование, сборка генома de novo, геномика, эпигеномика, метагеномика, длинные прочтения
Содержание Оригинальная статья
Ерёмин А.А., Сергеев А.В., Зверева М.Э., Хренова М.Г. Нанопоровое секвенирование в геномике, метагеномике и эпигеномике: инструменты и алгоритмы анализа. Математическая биология и биоинформатика. 2025;20(2):588-624. doi: 10.17537/2025.20.588
(опубликована на рус. яз.)

Аннотация (рус.)
Аннотация (англ.)
Полный текст (рус., pdf)
Список литературы

 

  Copyright ИМПБ РАН © 2005-2026