¹Колледж науки, Университет науки Аль-Карх, Багдад, Ирак
²Колледж науки, Университет Анбара, Рамади, Анбар, Ирак

Аннотация. Прогрессирующий фиброз определяет риск смертности при хронических заболеваниях печени. Современные методы диагностики не позволяют выявить молекулярный переход от раннего повреждения к необратимому рубцеванию. Они часто основаны на бинарных классификациях, скрывающих биологические факторы прогрессирования заболевания. Мы картировали профили экспрессии генов, дифференцирующие прогрессирующий (F3-F4) от раннего (F0-F2) фиброза, чтобы определить их клеточное происхождение и трансляционную способность на уровне белков при различных этиологиях заболевания. Мы проанализировали общедоступные данные массового секвенирования РНК (E-MTAB-6863), чтобы выделить гены, отличающие ранний фиброз от позднего. Затем мы деконволюировали эти сигналы с помощью секвенирования РНК отдельных ядер (snRNA-seq; GSE179548) для идентификации конкретных типов клеток. Мы подтвердили наличие кандидатов протеомным методом в мультиомическом наборе данных по гепатоцеллюлярной карциноме, сравнивая вирусную и метаболическую этиологию. Мы идентифицировали сигнатуру из 105 генов, ассоциированную с поздним фиброзом, обогащенную генами, отвечающими за организацию внеклеточного матрикса и развитие эпителия. snRNA-seq локализовал этот сигнал преимущественно в холангиоцитах, а не в звездчатых клетках печени, что указывает на реакцию желчных протоков. Протеомная валидация показала расхождение. Структурные маркеры (COL1A1, THY1) оставались повышенными независимо от этиологии. Метаболические и дуктулярные маркеры (AKR1B10, KRT23, SPP1) были специфичны для метаболических состояний (НАЖБП, алкогольная болезнь печени). Выраженный фиброз подпитывается реакцией билиарного эпителия, а не просто отложением матрикса. Фиброзный каркас сохраняется у всех пациентов. Сопутствующие метаболические адаптации зависят от этиологии. Это говорит о том, что эффективные биомаркеры должны быть адаптированы к конкретному метаболическому контексту заболевания, а не полагаться на универсальную панель для оценки фиброза.

Ключевые слова: фиброз печени, холангиоциты, дуктулярная реакция, мультиомика, этиологически специфические биомаркеры