Русская версияEnglish version   
Том 6   Выпуск 1   Год 2011
Электронная структура активного центра усеченного гемоглобина N в многоконфигурационном методе самосогласованного поля

Симон Константин Владимирович, Тулуб Александр Владимирович

Санкт-Петербургский государственный университет

Аннотация. В приближении многоконфигурационного метода самосогласованного поля (МКССП) выполнен расчет электронных свойств и оптимальной геометрии активного центра гемма trHbN с включением в состав системы функциональной группы (ONOO) и двух молекул воды. В качестве стартовых молекулярных орбиталей (МО) использованы локализованные МО. В волновой функции метода МКССП заданы два подпространства полного взаимодействия (CAS), это подпространство 3d-орбиталей атома железа и подпространство связывающих и разрыхляющих МО в пероксинитрите плюс орбиталь одной неподеленной электронной пары на фрагменте O2. Геометрия анионных структур (ONOO)-, возникающих в результате переноса заряда с Fe(II), близка к структурам нитратного аниона и пероксинитрита в газовой фазе. Пероксинитритная структура рассмотрена в двух различных спиновых состояниях, которые соответствуют синглетному и триплетному состояниям этого аниона в газовой фазе. Обсуждается возможная роль пероксинитритной структуры в связи с защитной реакцией M. tuberculosis.

Ключевые слова: защитная реакция бациллы туберкулеза, электронная структура активного центра гемма, волновые функции многоконфигурационного метода самосогласованного поля (МКССП).

Содержание Оригинальная статья
Мат. биол. и биоинф.
2011;6(1):23-38
doi: 10.17537/2011.6.23
опубликована на англ. яз.

Аннотация (англ.)
Аннотация (рус.)
Полный текст (англ., pdf)
Список литературы

 

  Copyright ИМПБ РАН © 2005-2019