Объединенный институт проблем информатики, Национальная академия наук Беларуси, Минск, 220012, Республика Беларусь
Институт биоорганической химии, Национальная академия наук Беларуси, Минск, 220141, Республика Беларусь

anishchenko.ivan@gmail.com

andrianov@iboch.bas-net.by

Аннотация. На основе анализа межмолекулярных взаимодействий гликосфинголипида β-галактозилцерамида с центральной областью петли V3 ВИЧ-1 осуществлен компьютерный дизайн его двух водорастворимых аналогов – потенциальных ингибиторов репликации вируса. В результате показано, что ключевую роль в формировании структурных комплексов гликолипидов с петлей V3 ВИЧ-1 играют взаимодействия перекрывающихся π-орбиталей боковой цепи консервативного фенилаланина ее иммунногенной “верхушки” Gly-Pro-Gly-Gln/Arg-Ala-Phe с XH–группами (X=C или O) остатка сахара. При этом существенный вклад в стабилизацию комплексов вносят водородные связи гидроксильных групп пиранозного кольца галактозы с полярными атомами основной цепи петли V3. Путем расчета величин энергии связывания сконструированных аналогов β-галактозилцерамида с пептидами петли V3 предсказана высокая вероятность проявления ими противовирусной активности.

Ключевые слова: ВИЧ-1, белок gp120, петля V3, β-галактозилцерамид, трехмерная структура, компьютерное моделирование, лекарственные препараты.