Русская версия English version   
Том 6   Выпуск 2   Год 2011
Компьютерный дизайн потенциальных лекарственных препаратов для терапии СПИДа: β-галактозилцерамид и петля V3 белка gp120 ВИЧ-1

Анищенко Иван Владимирович, Тузиков Александр Васильевич, Андрианов Александр Михайлович

Объединенный институт проблем информатики, Национальная академия наук Беларуси, Минск, 220012, Республика Беларусь
Институт биоорганической химии, Национальная академия наук Беларуси, Минск, 220141, Республика Беларусь

anishchenko.ivan@gmail.com

andrianov@iboch.bas-net.by



Аннотация. На основе анализа межмолекулярных взаимодействий гликосфинголипида β-галактозилцерамида с центральной областью петли V3 ВИЧ-1 осуществлен компьютерный дизайн его двух водорастворимых аналогов – потенциальных ингибиторов репликации вируса. В результате показано, что ключевую роль в формировании структурных комплексов гликолипидов с петлей V3 ВИЧ-1 играют взаимодействия перекрывающихся π-орбиталей боковой цепи консервативного фенилаланина ее иммунногенной “верхушки” Gly-Pro-Gly-Gln/Arg-Ala-Phe с XH–группами (X=C или O) остатка сахара. При этом существенный вклад в стабилизацию комплексов вносят водородные связи гидроксильных групп пиранозного кольца галактозы с полярными атомами основной цепи петли V3. Путем расчета величин энергии связывания сконструированных аналогов β-галактозилцерамида с пептидами петли V3 предсказана высокая вероятность проявления ими противовирусной активности.

Ключевые слова: ВИЧ-1, белок gp120, петля V3, β-галактозилцерамид, трехмерная структура, компьютерное моделирование, лекарственные препараты.
 

Содержание Оригинальная статья
Мат. биол. и биоинф.
2011;6(2):161-172
doi: 10.17537/2011.6.161
опубликована на рус. яз.

Аннотация (рус.)
Аннотация (англ.)
Полный текст (рус., pdf)
Список литературы

 

  Copyright ИМПБ РАН © 2005-2022