Русская версия English version   
Том 6   Выпуск 2   Год 2011
Пакет программ aSHAPE для изучения пространственной конформации участков бактериального генома

Панюков Валерий Васильевич, Назипова Нафиса Наиловна, Озолинь Ольга Николаевна

Институт математических проблем биологии, Российская академия наук, Пущино, Московская область, 142290, Россия
Институт биофизики клетки, Российская академия наук, Пущино, Московская область, 142290, Россия

panyukov@itaec.ru

Аннотация. Описывается интерактивный пакет aSHAPE для выявления пространственного конформационного различия и сходства в семействах участков ДНК на основе трёхмерной модели двойной спирали. Описано его применение для распознавания промоторных областей в геноме Escherichia coli.

Ключевые слова: конформационная цепочка, деформация, дискриминантный анализ, разделяющая функция, двойная спираль, промотор, ДНК.
 

 


 

Содержание Оригинальная статья
Мат. биол. и биоинф.
2011;6(2):211-227
doi: 10.17537/2011.6.211
опубликована на рус. яз.

Аннотация (рус.)
Аннотация (англ.)
Полный текст (рус., pdf)
Список литературы Перевод на англ. яз.
Мат. биол. и биоинф.
2011;6(2):t36-t52
doi: 10.17537/2011.6.t36

Полный текст (англ., pdf)

 

  Copyright ИМПБ РАН © 2005-2022