Русская версия English version   
Том 6   Выпуск 2   Год 2011
Адиабатическое приближение при расчетах подвижности заряда в холстейновской модели ДНК

Тихонов Дмитрий Анатольевич, Соболев Егор Васильевич, Лахно Виктор Дмитриевич, Фиалко Надежда Сергеевна

Институт математических проблем биологии, Российская академия наук, Пущино, Московская область, 142290, Россия

dmitry.tikhonov@gmail.com
fialka@impb.psn.ru


Аннотация. В холстейновской модели распространение заряда (квантовой частицы) вдоль цепочки сайтов и движения классических сайтов цепочки описывается самосогласованной системой ОДУ (поляронная модель). Для расчета подвижности заряда при заданной температуре окружающей среды рассмотрено линейное адиабатическое приближение, при котором движение заряда не влияет на смещения сайтов. В этом приближении расчет значительно ускоряется. Проведенное сравнение результатов расчета поляронной и рассматриваемой адиабатической моделей дает совпадающие величины коэффициента диффузии с точностью до стандартной ошибки среднего.

Ключевые слова: модель Холстейна, уравнение Ланжевена, подвижность, ДНК, адиабатическое приближение, метод Магнуса, аппроксимация матричной экспоненты

Содержание Оригинальная статья
Мат. биол. и биоинф.
2011;6(2):264-272
doi: 10.17537/2011.6.264
опубликована на рус. яз.

Аннотация (рус.)
Аннотация (англ.)
Полный текст (рус., pdf)
Список литературы

 

  Copyright ИМПБ РАН © 2005-2021