Русская версияEnglish version   
Том 8   Выпуск 1   Год 2013
О средствах формального анализа строя нуклеотидных цепей

Гуменюк А.С., Поздниченко Н.Н., Родионов И.Н., Шпынов С.Н.

Омский государственный технический университет, Омск, 644050, Россия
ФБУН «Омский НИИ природно-очаговых инфекций» Роспотребнадзора, Омск, 644080, Россия

nick670@yandex.ru
goruha@gmail.com
stan63@inbox.ru

Аннотация. Объектом исследования в данной работе является числовая последовательность, отображающая отдельную нуклеотидную цепь, названная строем и формально представляющая взаимное расположение компонентов последовательности ДНК. Сформулированы выражения для числовых характеристик, которые характеризуют порядок элементов цепи. Продемонстрированы некоторые возможности применения этих числовых характеристик для решения задач таксономии организмов, их сравнения, сегментации ДНК и отображения её локальной структуры.

Ключевые слова: количество информации, энтропия, числовые характеристики строя цепи, удаленность, регулярность, строй нуклеотидной цепи, рибонуклеиновая кислота, рибосомальная РНК, митохондриальная РНК.

Содержание Оригинальная статья
Мат. биол. и биоинф.
2013;8(1):373-397
doi: 10.17537/2013.8.373
опубликована на рус. яз.

Аннотация (рус.)
Аннотация (англ.)
Полный текст (рус., pdf)
Список литературы

 

  Copyright ИМПБ РАН © 2005-2019