Распознавание скрытой периодичности в последовательностях ДНК
Чалей М.Б., Кутыркин В.А.
Институт математических проблем биологии, Российская академия наук, Пущино, Московская область, 142290, Россия
Московский Государственный Технический Университет им. Н.А. Баумана, Москва, 107005, Россия
maramaria@yandex.ru
vkutyrkin@yandex.ru
Аннотация. На основе разработанного ранее спектрально-статистического подхода предложены прямые методы распознавания нового типа периодичности в последовательности ДНК – скрытой профильной периодичности, обобщающей известное понятие размытого тандемного повтора. Проведено сравнение предлагаемых методов с другими подходами, опирающимися только на косвенные признаки наличия скрытой периодичности в последовательности ДНК.
Ключевые слова: размытый тандемный повтор, скрытая профильная периодичность, статистический анализ текстовой структуры последовательности ДНК.