Русская версияEnglish version   
Том 14   Выпуск 2   Год 2019
Модульная графическая модель энергетического метаболизма в клетках скелетной мышцы

Киселев И.Н.1,2, Акбердин И.Р.2,3,6, Вертышев А.Ю.4, Попов Д.В.5, Колпаков Ф.А.1,2

1Институт вычислительных технологий СО РАН, Новосибирск, Россия
2ООО «БИОСОФТ.РУ», Новосибирск, Россия
3Новосибирский национальный исследовательский государственный университет, Новосибирск, Россия
4ЗАО "СИТЭС-ЦЕНТР", Москва, Россия
5Государственный научный центр Российской Федерации Институт медико-биологических проблем РАН, Москва, Россия
6Федеральный исследовательский центр Институт цитологии и генетики СО РАН, Новосибирск, Россия

Аннотация. В работе представлена модификация многокомпартментной математической модели, описывающей функционирование скелетной мышцы в норме на уровне метаболизма клетки. Предложено модульное представление комплексной модели, которое обеспечивает возможность оперативного расширения и модификации компартментов модели для учета сложной организации мышечных клеток и ограничений скорости диффузии метаболитов между внутриклеточными компартментами. В качестве иллюстрации работы модели рассмотрен внутриклеточный ответ в работающей скелетной мышце при аэробном физическом упражнении с постоянной нагрузкой на велоэргометре. Модель доступна по адресу: http://wiki.biouml.org/index.php/Muscle_metabolism.

 

Ключевые слова: математическая модель, модульное моделирование, скелетные мышцы, физическая нагрузка, метаболизм, физиология, BioUML.

Содержание Оригинальная статья
Мат. биол. и биоинф.
2019;14(2):373-392
doi: 10.17537/2019.14.373
опубликована на рус. яз.

Аннотация (рус.)
Аннотация (англ.)
Полный текст (рус., pdf)
Список литературы
Доп. материалы

 

  Copyright ИМПБ РАН © 2005-2019