Уточнение макромолекулярных структур без стереохимических ограничений как метод выявления альтернативных конформаций
Соболев О.В., Лунин В.Ю.
Институт математических проблем биологии Российская академия наук, Пущино, Московская область, 142290, Россия
Пущинский государственный университет, Пущино, Московская область, 142290, Россия
Аннотация. Выявление в белковой молекуле боковых цепей, присутствующих в кристалле в альтернативных конформациях является трудоемким этапом расшифровки макромолекулярной структуры методом рентгеноструктурного анализа. В нашей работе мы демонстрируем, что существенные изменения координат атомов боковых групп в процессе кристаллографического уточнения с отключенными стереохимическими ограничениями могут служить индикатором наличия альтернативных конформаций.
Ключевые слова: структура биологических макромолекул, кристаллографическое уточнение, альтернативные конформации.