Сравнительный анализ аминокислотных последовательностей отдельных доменов белков Нос бактериофагов подсемейства Teequatrovirinae
Зимин А.А., Микулинская Г.В., Нигматуллина Л.Ф., Назипова Н.Н.
Институт биохимии и физиологии микроорганизмов им. Г.К. Скрябина, Российская академия наук, Пущино, Московская область, 142290, Россия
Филиал Института биоорганической химии им. академиков М. М. Шемякина и Ю. А. Овчинникова, Российская академия наук, Пущино, Московская область, 142290, Россия
Институт математических проблем биологии, Российская академия наук, Пущино, Московская область, 142290, Россия
Аннотация. В данной работе представлены результаты сравнительного исследования иммуноглобулин-подобных доменов в геномах бактериофагов, родственных бактериофагу T4. Предложено использовать белки Hoc для классификации подсемейства фагов Teequatrovirinae. Осуществлен филогенетический анализ отдельных доменов 31 белка Нос бактериофагов подсемейства. Показано, что число доменов в белках Нос у разных бактериофагов подсемейства варьирует от одного до пяти. На основе этого бактериофаги можно разделить на 6 подгрупп. Филогенетическое дерево доменов белков продуктов генов hoc бактериофагов, родственных Т4, образует три основные ветви. Это ветвь С-концевых доменов, ветвь N-концевых доменов и ветвь промежуточных доменов. Обязательное присутствие С-концевого домена во всех белках Нос указывает на его функциональную и структурную значимость для формирования белка и его прикрепления к капсиду фага. Сформулированы гипотетические схемы эволюционного происхождения повторяющихся аминокислотных последовательностей в белках Нос.
Ключевые слова: бактериофаг T4, белок Hoc, иммуноглобулин-подобныe белки, домены, филогенетическое дерево, эволюция белков.