Русская версия English version   
Том 7   Выпуск 2   Год 2012
Сравнительный анализ аминокислотных последовательностей отдельных доменов белков Нос бактериофагов подсемейства Teequatrovirinae

Зимин А.А., Микулинская Г.В., Нигматуллина Л.Ф., Назипова Н.Н.

Институт биохимии и физиологии микроорганизмов им. Г.К. Скрябина, Российская академия наук, Пущино, Московская область, 142290, Россия
Филиал Института биоорганической химии им. академиков М. М. Шемякина и Ю. А. Овчинникова, Российская академия наук, Пущино, Московская область, 142290, Россия
Институт математических проблем биологии, Российская академия наук, Пущино, Московская область, 142290, Россия

Аннотация. В данной работе представлены результаты сравнительного исследования иммуноглобулин-подобных доменов в геномах бактериофагов, родственных бактериофагу T4. Предложено использовать белки Hoc для классификации подсемейства фагов Teequatrovirinae. Осуществлен филогенетический анализ отдельных доменов 31 белка Нос бактериофагов подсемейства. Показано, что число доменов в белках Нос у разных бактериофагов подсемейства варьирует от одного до пяти. На основе этого бактериофаги можно разделить на 6 подгрупп. Филогенетическое дерево доменов белков продуктов генов hoc бактериофагов, родственных Т4, образует три основные ветви. Это ветвь С-концевых доменов, ветвь N-концевых доменов и ветвь промежуточных доменов. Обязательное присутствие С-концевого домена во всех белках Нос указывает на его функциональную и структурную значимость для формирования белка и его прикрепления к капсиду фага. Сформулированы гипотетические схемы эволюционного происхождения повторяющихся аминокислотных последовательностей в белках Нос.

Ключевые слова: бактериофаг T4, белок Hoc, иммуноглобулин-подобныe белки, домены, филогенетическое дерево, эволюция белков.
 

Содержание Оригинальная статья
Мат. биол. и биоинф.
2012;7(2):611-631
doi: 10.17537/2012.7.611
опубликована на рус. яз.

Аннотация (рус.)
Аннотация (англ.)
Полный текст (рус., pdf)
Список литературы
Доп. материалы Перевод на англ. яз.
Мат. биол. и биоинф.
2018;13(Suppl.):t39-t58
doi: 10.17537/2018.13.t39

Полный текст (англ., pdf)

 

  Copyright ИМПБ РАН © 2005-2024