Русская версияEnglish version   
Том 8   Выпуск 2   Год 2013
Распознавание и анализ устойчивости структурных мотивов типа α-α-уголок в глобулярных белках

Руднев В.Р., Панкратов А.Н., Куликова Л.И., Дедус Ф.Ф., Тихонов Д.А., Ефимов А.В.

Институт математических проблем биологии РАН, 142290, Пущино, ул. Институтская, д.4
Факультет ВМК МГУ имени М.В. Ломоносова, 119991 ГСП-1, Москва, Ленинские горы
Институт белка РАН, 142290, Пущино, ул. Институтская, д.4

volodyarv@mail.ru

Аннотация. Рассматривается задача распознавания структурных мотивов белков на примере α-α-уголков. Предложен комбинированный подход к решению задач анализа пространственной структуры белков на основе аналитического описания основной цепи белковой глобулы и спектрального метода распознавания повторов. Нами найдено 110 α-α-уголков в базе данных PDB, соответствующих заданному эталону. Методом молекулярной динамики показано, что α-α-уголки как автономные структуры устойчивы в водной среде.

 

Ключевые слова: распознавание образов, ортогональные полиномы, аналитическое описание, супервторичные структуры белков.

Содержание Оригинальная статья
Мат. биол. и биоинф.
2013;8(2):398-406
doi: 10.17537/2013.8.398
опубликована на рус. яз.

Аннотация (рус.)
Аннотация (англ.)
Полный текст (рус., pdf)
Список литературы

 

  Copyright ИМПБ РАН © 2005-2019