Аннотация. В статье рассмотрены два способа нахождения свободной энергии, использующие термодинамически равновесные характеристики, которые рассчитаны прямым вычислительным экспериментом. Приведены результаты расчетов для однородных нуклеотидных димеров AA, GG и TT. Оба способа дают близкие результаты в области биологически значимых температур.

 

Ключевые слова: ДНК, димер, уравнение Ланжевена, полная энергия, энтропия.