Статистический анализ и предсказание неструктурированных остатков в белковых структурах
Лобанов Михаил Юрьевич, Галзитская Оксана Валериановна
Учреждение Российской академии наук Институт белка РАН, 142290 Пущино Московской обл., ул. Институтская, 4; факс: 8(4967)318-435
Аннотация. Получены данные по статистике встречаемости неструктурированных аминокислотных остатков на концах и в средней части белковой цепи. Создан алгоритм, основанный на модели Изинга (модели двух состояний) для предсказания неструктурированных остатков по аминокислотной последовательности. Тестирование данного метода на двух дополнительных базах показало, что наш метод входит в пятерку лучших.
Ключевые слова: неструктурированные остатки, модель Изинга, чувствительность, специфичность.