Индивидуально ориентированная модель для имитации популяционно-генетических процессов у видов, населяющих одномерный ареал
Букин Ю.С., Горбылев А.Л.
Национальный исследовательский Иркутский государственный технический университет, Иркутск, 664074, Россия
Лимнологический институт СО РАН, Иркутск, 664033, Россия
bukinyura@mail.ru
Аннотация. В работе предлагается имитационная модель, описывающая популяционно-генетические процессы у вида, населяющего одномерный (ленточный) ареал. В процессе имитационного моделирования учитываются: начальное распределение организмов по ареалу; подвижность особей; распределение плотности ресурсов на ареале; вероятность возникновения нуклеотидной замены в митохондриальном и ядерном генетическом маркере; продолжительность имитационного процесса в поколениях. Модель предназначена для «проигрывания» различных сценариев формирования генетического разнообразия. Полученные в ходе моделирования последовательности ДНК можно сравнить с последовательностями ДНК выборок организмов из естественных популяций для проверки гипотез формирования генетического разнообразия. Программно реализованный алгоритм модели и исходный код можно получить по адресу: https://yadi.sk/d/80YAOsvYckiTr.
Ключевые слова: имитационное моделирование, индивидуально ориентированная модель, генетика популяций, популяционные процессы, дрейф генов, потоки генов, мутационный процесс, диффузионные процессы.