Русская версия English version   
Том 10   Выпуск 1   Год 2015
Поиск реликтовых рибонуклеотидных и аминокислотных последовательностей, игравших ключевую роль в формировании рибосомы и современного разнообразия белков

Скобликов Н.Э., Зимин А.А.

Северо-Кавказский научно-исследовательский институт животноводства, Краснодар, Россия
Институт биохимии и физиологии микроорганизмов им. Г.К. Скрябина, Российская академия наук, Пущино, Московская область, Россия

Аннотация. Представлены результаты анализа базы данных белковых последовательностей прокариотических микроорганизмов, выявившего наличие элементов консервативной пептидной последовательности длиной 11 аминокислотных остатков в 20 локусах 16 функционально и филогенетически различных консервативных белков у представителей различных таксонов. Этот аминокислотный мотив IKAVRELGLER, возможно, является одним из последних общих предшественников матрично-синтезируемых пептидов (Last Universal Peptide Ancestors, LUPA). Источником генетической информации такой последовательности, по всей вероятности, служит фрагмент рибосомной РНК (участок A-сайта, включающий ветви H92, H90 и H93 пептидил-трансферазного центра), транслированный с одной из возможных рамок считывания. Такой фрагмент рРНК, исполнявший функцию матрицы для синтеза LUPA, назван нами последним общим РНК-предшественником (Last Universal RiboNucleic Ancestor, LURNA). Предполагается, что LURNA и транслируемые с него пептидные продукты послужили источником формирования современного разнообразия пептидов.

Ключевые слова: рибосома, рибосомная РНК, трансляция, пептидил-трансферазный центр, универсальный пептидный мотив, Last Universal Peptide Ancestor, LUPA, Last Universal RiboNucleic Ancestor, LURNA.

 
Содержание Оригинальная статья
Мат. биол. и биоинф.
2015;10(1):116-130
doi: 10.17537/2015.10.116
опубликована на англ. яз.

Аннотация (англ.)
Аннотация (рус.)
Полный текст (англ., pdf)
Список литературы Перевод на рус. яз.
Мат. биол. и биоинф.
2015;10(1):t39-t55
doi: 10.17537/2015.10.t39

Полный текст (рус., pdf)

 

  Copyright ИМПБ РАН © 2005-2024