Поиск регулярных последовательностей в промоторах из геномов различных групп организмов с использованием критерия серий
Шеленков А.А., Коротков Е.В.
Центр «Биоинженерия» Российской академии наук, Москва, 117312, Россия
Аннотация. В статье вводится понятие «регулярность» для описания структурных свойств последовательностей ДНК, расширяющее понятие скрытой периодичности. Предложен метод обнаружения регулярности с использованием критерия серий. Проведенный поиск регулярных последовательностей в эукариотических промоторах показал, что более 60% из них обладают регулярностью на статистически значимом уровне. Обсуждаются возможные биологические функции регулярности и возможность использования данной характеристики для аннотации промоторов.
Ключевые слова: регулярность, промоторы, последовательности ДНК.