Компьютерная оценка активности фитохимического вещества нарингенина и его производных в отношении вируса денге DENV2
Ачарья С., Сатпати Р.
Школа биотехнологии, Университет Гангадхара Мехера, Амрута Вихар, Самбалпур, Одиша, Индия
Аннотация. Лихорадка денге, одно из наиболее распространенных вирусных инфекционных заболеваний XXI века, передается комарами и поражает примерно 100–400 миллионов человек во всем мире. Общепризнанных успешных методов лечения до сих пор нет, несмотря на множество исследований в in vitro и in silico поиске потенциальных противовирусных средств. РНК-хеликаза вируса денге (DENV) — это жизненно важный белок, играющий важную роль в репликации вируса. В данном исследовании анализировалась противовирусная активность флаванона нарингенина и его производных, воздействующих на NS3 хеликазу DENV. В этой работе с помощью компьютерного скрининга, основанного на молекулярном докинге и ADMET-свойствах 20 производных нарингенина, в качестве самого перспективного был идентифицирован 6-фторнарингенин. Кроме того, сравнительные MD-симуляции и исследование MM-PBSA для комплексов, таких как NS3-нарингенин, NS3-6-фторнарингенин и NS3-ST-610 (стандартная молекула ингибитора), показали, что нарингенин способен образовывать стабильный комплекс с ферментом NS3-хеликазой вируса денге 2 типа (DENV2). Эти результаты предсказывают перспективную противовирусную активность нарингенина в качестве ингибитора репликации вируса денге.
Ключевые слова: вирус денге, NS3 хеликаза, нарингенин, молекулярный докинг, моделирование молекулярной динамики, противовирусная активность