Русская версия English version   
Том 9   Выпуск 1   Год 2014
Экспериментальные и теоретические методы изучения ионных каналов

Турченков Д.А., Быстров В.С.

Институт математических проблем биологии РАН, Россия, Пущино, 142290, ул. Институтская, д.4
НИЦ «БиоСим», Россия, Москва, 115211, Каширское ш., д. 55/3
Центр исследования керамики и композитов (ЦИКЕКО), Университет Авейро, 3810-193, Авейро, Португалия

Аннотация. В данной работе проводится обзор основных типов и свойств ионных каналов, существующих экспериментальных, теоретических подходов и моделей описания их функционирования. В статье рассмотрены конфигурации методов фиксации потенциала, patch-clamp методика, особое внимание уделено математическим моделям ионных каналов на примере применения методов молекулярной и броуновской динамики, решения уравнения Пуассона–Нернста–Планка, а также современных комбинированных подходов. Существующие ab initio методы квантовой химии представлены теорией функционала плотности (DFT). Для каждой из методик приводятся характерные задачи, решаемые в ее рамках, основные преимущества и недостатки.
 
Ключевые слова: ионные каналы, моделирование, молекулярная динамика, уравнение Ланжевена, DFT.
 

 

Содержание Оригинальная статья
Мат. биол. и биоинф.
2014;9(1):112-148
doi: 10.17537/2014.9.112
опубликована на рус. яз.

Аннотация (рус.)
Аннотация (англ.)
Полный текст (рус., pdf)
Список литературы

 

  Copyright ИМПБ РАН © 2005-2022