Русская версия English version   
Том 7   Выпуск 2   Год 2012
Соболев О.В., Лунин В.Ю.

Использование программы кристаллографического уточнения Refmac в процессе выявления альтернативных конформаций в биологических макромолекулах

Математическая биология и биоинформатика. 2012;7(2):692-702.

doi: 10.17537/2012.7.692.

Список литературы

  1. Howard EI, Sanishvili R, Cachau RE, Mitschler A, Chevrier B, Barth P, Lamour V, Van Zandt M, Sibley E, Bon C, Moras D, Schneider TR, Joachimiak A, Podjarny A. Proteins. 2004;55:792-804. doi: 10.1002/prot.20015
  2. Ševčík J, Dauter Z, Wilson KS. Acta Crystallographica D. 2004;60:1198-1204. doi: 10.1107/S0907444904009035
  3. Wang J, Dauter M, Alkire R, Joachimiak A, Dauter Z. Acta Crystallographica D. 2007;63:1254-1268. doi: 10.1107/S0907444907054224
  4. Rypniewski WR, Østergaard P, Nørregaard-Madsen M, Dauter M, Wilson KS. Acta Crystallographica D. 2001;57:8-19.
  5. Getzoff ED, Gutwin KN, Genick UK. Nat. Struct. Biol. 2003;10:663-668.
  6. Kursula I, Wierenga RK. J. Biol. Chem. 2003;278:9544-9551.
  7. Addlagatta A, Krzywda S, Czapinska H, Otlewski J, Jaskolski M. Acta Crystallographica D. 2001;57:649-663. doi: 10.1107/S0907444901003468
  8. Dauter Z, Sierer LC, Wilson KS. Acta Crystallographica D. 1992;48:42-59. doi: 10.1107/S0108767391008681
  9. Dodd FE, Hasnain SS. Acta Crystallographica D. 1995;51:1052-1064. doi: 10.1107/S0907444995007554
  10. Koepke J, Scharff EI, Lücke C, Rüterjans H, Fritzsch G. Acta Crystallographica D. 2003;59:1744-1754. doi: 10.1107/S0907444903016135
  11. Sobolev ОV, Lunin VY. Mathematical Biology and Bioinformatics. 2008;3:50-59. doi: 10.17537/2008.3.50
  12. Sobolev OV, Lunin VY. Acta Crystallographica D. 2012;68:1118-1127. doi: 10.1107/S0907444912021269
  13. Sobolev OV. Computational Crystallography Newsletter. 2012;3:32-34.
  14. Afonine PV, Grosse-Kunstleve RW, Echols N, Headd JJ, Moriarty NW, Mustyakimov M, Terwilliger TC, Urzhumtsev A, Zwart PH, Adams PD. Acta Crystallographica D. 2012;68:352-367. doi: 10.1107/S0907444912001308
  15. Murshudov GN, Skubak P, Lebedev AA, Pannu NS, Steiner RA, Nicholls RA, Winn MD, Long F, Vagin AA. Acta Crystallographica D. 2011;67:355-367. doi: 10.1107/S0907444911001314
  16. Berman HM, Westbrook J, Feng Z, Gilliland G, Bhat TN, Weissig H, Shindyalov IN, Bourne PE. Nucleic Acids Res. 2000;28:235-242. doi: 10.1093/nar/28.1.235
  17. Noivirt-Brik O, Prilusky J, Sussman JL. Proteins. 2009;77(9):210-216. doi: 10.1002/prot.22586
  18. Fawcett T. Pattern Recognition Letters. 2006;27:861-874. doi: 10.1016/j.patrec.2005.10.010
  19. Antson AA, Smith DJ, Roper DI, Lewis S, Caves LS, Verma CS, Buckley SL, Lillford PJ, Hubbard RE. J. Mol. Biol. 2010;305:875-889.
Содержание Оригинальная статья
Мат. биол. и биоинф.
2012;7(2):692-702
doi: 10.17537/2012.7.692
опубликована на рус. яз.

Аннотация (рус.)
Аннотация (англ.)
Полный текст (рус., pdf)
Список литературы Перевод на англ. яз.
Мат. биол. и биоинф.
2012;7(2):t16-t24
doi: 10.17537/2012.7.t16

Полный текст (англ., pdf)

 

  Copyright ИМПБ РАН © 2005-2024