Русская версияEnglish version   
Том 8   Выпуск 1   Год 2013
Любецкий В.А., Селиверстов А.В., Зверков О.А.

Построение разделяющих паралоги семейств гомологичных белков, кодируемых в пластидах цветковых растений

Математическая биология и биоинформатика. 2013;8(1):225-233.

doi: 10.17537/2013.8.225.

Список литературы

  1. Zverkov OA, Seliverstov AV, Liubetskii VA. Molekuliarnaia biologiia (Molecular Biology). 2012;46(5):799-809 (in Russ.).
  2. Zverkov OA, Rusin LIu, Seliverstov AV, Liubetskii VA. Vestnik Moskovskogo universiteta. Seriia 16: Biologiia (Moscow University Biological Sciences Bulletin). 2013(1):12-17 (in Russ.).
  3. Altenhoff AM, Dessimoz C. Phylogenetic and functional assessment of orthologs inference projects and methods. PLoS Computational Biology. 2009;5(1):e1000262. http://dx.plos.org/10.1371/journal.pcbi.1000262 (accessed 14 April 2013). doi: 10.1371/journal.pcbi.1000262
  4. Zaguskin VL. Circumscribed and inscribed ellipsoids of extremal volume. Uspekhi Mat. Nauk. 1958;13(6):89-93 (in Russ.).
  5. Tamura K, Peterson D, Peterson N, Stecher G, Nei M, Kumar S. MEGA5: molecular evolutionary genetics analysis using maximum likelihood, evolutionary distance, and maximum parsimony methods. Molecular Biology and Evolution. 2011;28:2731-2739. doi: 10.1093/molbev/msr121
  6. Finn RD, Mistry J, Tate J, Coggill P, Heger A, Pollington JE, Gavin OL, Gunasekaran P, Ceric G, Forslund K. et al. The Pfam protein families database. Nucleic acids research. 2010;38:D211-D222. http://nar.oxfordjournals.org/content/38/suppl_1/D211.full (accessed 14 April 2013). doi: 10.1093/nar/gkp985
  7. Needleman SB, Wunsch CD. A general method applicable to the search for similarities in the amino acid sequence of two proteins. Journal of Molecular Biology. 1970;48(3):443-453. doi: 10.1016/0022-2836(70)90057-4
  8. BLOSUM Clustered Scoring Matrix. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Class/FieldGuide/BLOSUM62.txt (accessed 14 April 2013).
  9. Kruskal JB. On the Shortest Spanning Subtree of a Graph and the Traveling Salesman Problem. In: Proceedings of the American Mathematical Society. 1956;7(1):48-50. doi: 10.1090/S0002-9939-1956-0078686-7
  10. Jaillon O, Aury JM, Noel B, Policriti A, Clepet C, Casagrande A, Choisne N, Aubourg S, Vitulo N, Jubin C. et al. The grapevine genome sequence suggests ancestral hexaploidization in major angiosperm phyla. Nature. 2007;449(7161):463-467. doi: 10.1038/nature06148
Содержание Оригинальная статья
Мат. биол. и биоинф.
2013;8(1):225-233
doi: 10.17537/2013.8.225
опубликована на рус. яз.

Аннотация (рус.)
Аннотация (англ.)
Полный текст (рус., pdf)
Список литературы

 

  Copyright ИМПБ РАН © 2005-2019